La Pernía fue ya habitada durante la prehistoria, en algunas
cuevas se han hallado restos arqueológicos de esta época, pinturas
rupestres, útiles y restos de cerámica.
Aproximadamente 1.000 años antes de cristo se produjo la entrada de pueblos
celtas a la península, ocupando esta zona los cantabros.
La romanización en Cantabria se produjo tarde y no fue nunca completa. La guerra contra los romanos
fue larga y dura.
Las invasiones visigodas tampoco penetraron demasiado en esta zona. En el siglo VII, durante el reinado del rey visigodo Ervigio,
se constituyo el Ducado de Cantabria, que abarcaba prácticamente el mismo
territorio de los cantabros.
Hasta que no se produce la llegada de gran cantidad de gente de la meseta, huyendo de los
musulmanes, en el siglo VIII, apenas cambia la forma de vida de los cantabros.
En esta época se producen muchos cambios en las costumbres de este pueblo.
Se extiende el cristianismo, situando iglesias en lugares sagrados para los
cantabros, la economía se hace mas agrícola y ganadera, se crean nuevos núcleos
de población.
Con la Reconquista, a finales del siglo VIII y principios del
IX, parte de la población se marcha a repoblar los territorios
conquistados al norte del Duero, son los foramontanos.
En los siglos XI y XII, durante el régimen feudal se obliga al pueblo a delimitar los terrenos, con lo que la propiedad
común se vuelve privada, se rompe la tradicional familia o clan numeroso con el
establecimiento de la monogamia y el castigo del adulterio y se conceden
títulos a los miembros más destacados de la población.
La unidad económica más pequeña es el solar, donde se encuentra la casa y
tierras de una familia. No obstante la población se va agrupando, continúa el
periodo de expansión demográfica, aparecen nuevas aldeas en torno a
monasterios, explotaciones familiares, iglesias...
A finales del siglo XII se crearon unas divisiones territoriales en el reino
de Castilla llamadas merindades. Se conoce poco sobre estas, aunque parece
que La Pernía entraría dentro de la llamada "Peñas de Amaya fasta el
Mar". En 1352 se redacta el Libro de las Merindades de Castilla o
"Becerro de las Behetrías" que distribuye el territorio cántabro en
4 merindades: La Merindad de Liébana y Pernía incluía ambas comarcas y el
valle de Polaciones. La capital estaría en Cervera de Pisuerga. En este libro
está la primera constancia escrita de Casavegas (la casa de las vegas).
Perteneció al antiguo condado de Pernía, concedido por los
reyes castellanos al obispo Sancho de Rojas de Palencia a principios del siglo
XII.